Mestrado (PPG-BPA) - CCBS
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Item Análise comparativa da ocorrência de epítopos lineares na glicoproteína de lissavírus dos filogrupos I e II(Universidade do Estado do Pará, 2026) LIMA, André Miller Cortêz; COELHO, Taciana Fernandes Souza Barbosa; http://lattes.cnpq.br/3736447891320647; CARVALHO, Carlos Alberto Marques de; http://lattes.cnpq.br/8700672339331484Os lissavírus constituem um grupo de vírus neurotrópicos responsáveis por encefalite letal, com destaque para o vírus da raiva. A proteína G desses vírus desempenha papel central na infecção, sendo o principal alvo das imunidades adaptativas humoral e mediada por células. Nesse contexto, o presente estudo teve como objetivo analisar comparativamente a ocorrência de epítopos lineares de células B e T CD4+ no ectodomínio da proteína G de lissavírus pertencentes aos filogrupos I (RABV, EBLV-1, EBLV-2, DUVV e ABLV) e II (LBV e MOKV), por meio de abordagens de bioinformática. As sequências aminoacídicas da proteína G foram obtidas por tradução conceitual a partir do genoma viral de referência disponível no GenBank, processadas no SignalP e no TMHMM para isolamento do ectodomínio, alinhadas no Clustal Omega para determinação de identidade percentual e submetidas ao EMBOSS Cons para geração de sequências consenso. A predição de epítopos de células T CD4+ foi realizada com base na análise da afinidade de ligação a alelos de HLA-II pelo NetMHCIIpan com auxílio do Epitope-Evaluator, enquanto epítopos de células B foram identificados a partir da combinação de parâmetros de hidroficilidade, acessibilidade e flexibilidade no NPS@ PCProf, avaliando-se também o potencial mascaramento por N-glicanos no NetNGlyc. Os resultados evidenciaram a identidade aminoacídica de 76,71% a 83,79% no filogrupo I e 82,72% no filogrupo II. Observou-se maior densidade de epítopos para HLA-II no filogrupo I (0,22) em relação ao filogrupo II (0,18). Embora a antigenicidade média tenha sido maior em metades distintas do ectodomínio da proteína G em cada filogrupo de lissavírus, epítopos lineares de células B contidos em posições equivalentes dos filogrupos I e II (FKRKHF e TFKRKHFK, respectivamente) se sobrepuseram a peptídeos comumente ligados pelo alelo DRB1*15:01 de HLA-II (TYTNFVGYVTTTFKR, YTNFVGYVTTTFKRK e TNFVGYVTTTFKRKH) e não mascarados por N-glicanos, sugerindo relevância funcional em respostas de anticorpos dependentes de células T CD4+. Em conjunto, esses achados contribuem para a compreensão de determinantes antigênicos da proteína G e fornecem subsídios para o desenvolvimento de estratégias vacinais e imunoprofiláticas mais abrangentes contra lissavírus.;Lyssaviruses comprise a group of neurotropic viruses responsible for lethal encephalitis, most notably the rabies virus. The G protein of these viruses plays a central role in infection, being the main target of humoral and cell-mediated adaptive immunity. In this context, the present study aimed to comparatively analyze the occurrence of linear B and CD4+ T cell epitopes in the ectodomain of the G protein of lyssaviruses belonging to phylogroups I (RABV, EBLV-1, EBLV-2, DUVV, and ABLV) and II (LBV and MOKV), using bioinformatics approaches. The amino acid sequences of the G protein were retrieved by conceptual translation from the reference viral genome available in GenBank, processed in SignalP and TMHMM for ectodomain isolation, aligned in Clustal Omega for percentage identity determination, and submitted to EMBOSS Cons for consensus sequence generation. Prediction of CD4+ T cell epitopes was performed based on analysis of binding affinity to HLA-II alleles using NetMHCIIpan with the aid of Epitope-Evaluator, while B cell epitopes were identified from the combination of hydrophilicity, accessibility, and flexibility parameters in NPS@ PCProf, also evaluating the potential masking by N-glycans in NetNGlyc. The results showed amino acid identity of 76.71% to 83.79% in phylogroup I and 82.72% in phylogroup II. A higher density of HLA-II epitopes was observed in phylogroup I (0.22) compared to phylogroup II (0.18). Although the average antigenicity was higher in distinct halves of the G protein ectodomain in each lyssavirus phylogroup, linear B cell epitopes contained in equivalent positions of phylogroups I and II (FKRKHF and TFKRKHFK, respectively) overlapped to peptides commonly bound by the HLA-II DRB1*15:01 allele (TYTNFVGYVTTTFKR, YTNFVGYVTTTFKRK, and TNFVGYVTTTFKRKH) and not masked by N-glycans, suggesting functional relevance in CD4+ T cell-dependent antibody responses. Taken together, these findings contribute to the understanding of antigenic determinants of the G protein and provide support for the development of more comprehensive vaccine and immunoprophylactic strategies against lyssaviruses.Item Estudo sobre o potencial de infecção da cepa brasileira de West Nile virus em Culex quinquefasciatus Say, 1823 (Diptera: Culicidae) da Região Amazônica.(Universidade do Estado do Pará, 2021-07-26) REIS, Lúcia Aline Moura; SILVA, Eliana Vieira Pinto da; http://lattes.cnpq.br/8891336848948014; https://orcid.org/0000-0003-3319-1854; NUNES NETO, Joaquim Pinto; http://lattes.cnpq.br/2340850717453533; https://orcid.org/0000-0001-5981-0065; https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=10979419A Febre do Nilo Ocidental é uma arbovirose causada pelo West Nile virus (WNV), cujos principais vetores são mosquitos do gênero Culex spp., dentre eles Culex quinquefasciatus... Com isso, o presente estudo objetivou avaliar a competência vetorial de fêmeas de Culex quinquefasciatus da cidade de Ananindeua, Estado do Pará (Região Amazônica), oralmente infectadas com uma cepa brasileira de WNV (cepa BE AN 854747) a fim de verificar a susceptibilidade dessa população, determinar o título viral nas regiões de corpo, cabeça e saliva e calcular as taxas de infecção, disseminação e transmissão viral... Conclui-se que, a população de Culex quinquefasciatus estudada possui alta susceptibilidade a infecção pela cepa brasileira do WNV com elevada competência vetorial e probabilidade de a espécie tornar-se um vetor importante do vírus, uma vez que a cepa brasileira estudada foi capaz de superar as barreiras anatômicas, com constante disseminação viral ao longo dos 21 dias avaliados, permitindo assim sua transmissão para diversos hospedeiros vertebrados, incluindo os invertebrados.;West Nile Fever is an arboviruss caused by the West Nile virus (WNV), whose main vectors are mosquitoes of the Culex spp. genus, including Culex quinquefasciatus... Thus, the present study aimed to evaluate the vector competence of females of Culex quinquefasciatus from the Ananindeua city (Amazon Region) orally infected with WNV (strain BE AN 854747) to verify the viability of infection in this population, to determine the viral titer in the body and head regions and also saliva, in order to calculate WNV infection, dissemination and transmission rates... We concluded that the population of Culex quinquefasciatus studied has a high susceptibility to WNV infection with high vector competence and probability of the species becoming an important vector of the virus, since the Brazilian strain studied was able to overcome anatomical barriers, with constant viral dissemination over the 21 days evaluated, thus allowing its transmission to animals and humans.